FREDA
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{DE}FREDA ist eine R-Package-Suite zur Kuration und Augmentierung klinisch-onkologischer Routinedaten, die im Rahmen des DataSHIELD-Frameworks entwickelt wurde. Die Software vereinfacht und standardisiert Prozesse der Datenharmonisierung, -kuration und -aumentierung in einer föderierten Analyseumgebung und kommt derzeit in Analyseprojekten der Clinical Data Science Group der Clinical Communication Platform des Deutschen Konsortiums für Translationale Krebsforschung (DKTK) zum Einsatz.
FREDA ist ein umfassendes Framework, das aus drei R-Packages besteht: dsFreda, das auf der Server-Seite zu Einsatz kommt; dsFredaClient, mit dem man von Client-Seite die Ausführung serverseitiger Funktionen gesteuert werden kann und der FredaApp, einer R-Shiny Anwendung, die als visuelle Unterstützung zum Monitoring der angestoßenen Prozesse fungiert.
Das langfristige Ziel von FREDA ist es, in föderierten Analysestrukturen einen Standard zur Datenharmonisierung, -kuration und -agumentierung zu etablieren, der für klinische Daten unterschiedlicher Provenienz eingesetzt werden kann.
Das Projekt wird von Bastian Reiter geleitet.{/DE}
{EN}FREDA is an R package suite for curating and augmenting routine clinical oncology data, developed as part of the DataSHIELD framework. The software simplifies and standardizes data harmonization, curation, and augmentation processes in a federated analysis environment and is currently used in analysis projects by the Clinical Data Science Group of the Clinical Communication Platform of the German Consortium for Translational Cancer Research (DKTK).
FREDA is a comprehensive framework consisting of three R packages: dsFreda, which is used on the server side; dsFredaClient, which can be used to control the execution of server-side functions from the client side; and FredaApp, an R Shiny application that provides visual support for monitoring the initiated processes.
The long-term goal of FREDA is to establish a standard for data harmonization, curation, and augmentation in federated analysis structures that can be used for clinical data from different sources.
The project is led by Bastian Reiter.
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